Arquitectónicamente, esta antigua ciudad maya se caracteriza porque posee unas plataformas residenciales muy antiguas, aproximadamente de 1,000 años A.D.C., también el campo de pelota cuenta con una edad de 800 años A.D.C., uno de los más antiguos fechados en Mesoamérica. Las Pirámides Triádicas, adornadas con mascarones de estuco, flanqueando escalinatas y 3 templetes en su cúspide, típicas del Preclásico son de las mayores después de las de El Mirador. Nakbé esta compuesto por 2 grandes grupos arquitectónicos.
La Estela 1, localizada en el Grupo Oriental, ha sido fechada estilísticamente en el año 400 A.D.C,. Un dato muy importante es que existen numerosas canteras de piedra caliza utilizada para la construcción de monumentos y pequeñas calzadas desde épocas muy tempranas.